近日,中国科学院古脊椎动物与古人类研究所卢静研究员带领团队发表了一种基于开源三维可视化软件Drishti的新方法。这种方法打破了不同三维软件之间三维重建结果无法互通和交叉验证的壁垒,实现不同三维可视化软件文件的二次分割与可视化。该成果于6月12日发表在《皇家学会开放科学》(Royal Society Open Science)期刊上。

CT等三维成像技术在生物学和古生物学中应用日益广泛,对成像数据的分割、重建和可视化工作提出了更大的挑战。然而,不同三维重建软件平台之间长期存在文件不互通的壁垒,给上述工作带来了不必要的困难。卢静研究员团队通过对开源三维可视化软件Drishti进行二次开发,提出了一种新方法,解决了不同平台上三维分割数据无法共享和二次重建的问题,极大促进了分割数据的互通和可验证性。

新方法允许对在不同三维可视化软件中分割的三维体数据进行进一步检查和二次重建,对协作研究和交叉验证三维重建结果具有重要意义。团队以四个不同样本和三种主流三维可视化平台作为案例,展示了分割数据在Drishti中的无缝转移和二次重建。这一方法开辟了验证分割数据准确性的新途径。

新方法使用了主流的图像处理和3D可视化技术,最大程度上保持了不同软件平台和体数据格式之间的统一性和互操作性。它高效地解决了由于兼容性、可访问性和经济性问题所造成的限制和障碍,方法简单易用,能够广泛应用,并保持了生成直观视觉表现的功能,从而提高了研究者之间的合作效率。通过促进不同主流三维可视化平台之间的互操作性,该方法在准确性验证和跨学科合作研究方面展示了巨大潜力,对于未来高效、精准地重建和渲染化石和其他生物材料扫描所得的三维体数据具有重要意义。

此外,该研究已经应邀参加美国NoCTURN(非医学CT扫描数据)计划,将进一步推动三维分割、重建效率的提高以及科学研究数据的共享。

论文链接:https://royalsocietypublishing.org/doi/10.1098/rsos.240375

图. Drishti v2.7中重新分割和可视化三维分割体数据工作流程